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Graphpad Prism棱镜科研绘图工具基本简介
Graphpad Prism 是一款优秀的统计绘图软件,集生物统计、曲线拟合、科研绘图于一体。软件专门为科研工作者设计,可以轻松地进行统计分析并绘制统计图,已被世界知名学府、科研机构、医学中心和制药企业广泛使用。Graphpad Prism 具有功能实用、操作便捷等特点,自推出以来受到了很多用户的喜爱,该软件集生物统计、曲线拟合和科学绘图于一体,可以帮助医学人员轻轻松松就可以制作出专业的医学表。
Graphpad Prism棱镜科研绘图工具软件科普
非线性回归是分析数据的重要工具,但往往比需要的难度更大。 没有其他程序能像 Prism 那样简化曲线拟合。 事实上,你通常可以在一个步骤中适合曲线。 只需从常用方程式的广泛列表中选择一个方程式(或输入您自己的方程式),Prism 会自动完成其余部分 – 适合曲线,以表格形式显示结果,在曲线图上绘制曲线,并插入未知值。将多个数据集的数据并排放置在有组织的数据表上,而 Prism 可以一次将所有的数据集合在一起。 您可以分别将相同的模型拟合到每个数据集,使用全局非线性回归在数据集之间共享参数值,或将不同的模型拟合到不同的数据集。
麻雀虽小五脏俱全,Prism 也为您提供了许多先进的配件选择。它可以将最佳拟合参数的置信区间报告为非对称范围(P值相似方法),它比通常的对称区间要精确得多。 它还可以自动插入标准曲线中的未知值(即分析RIA数据),使用F检验或Akaike信息准则(AIC)比较两个方程的拟合,绘制残差,识别异常值,差异重量数据点,测试正常性的残差等等。
Graphpad Prism棱镜科研绘图工具软件功能
科技绘图
1. 操作简单快捷:
1.1 输入数据后,软件自动生成统计图,无需专门绘制。
1.2 工具栏按钮简洁明了,一键式操作,包含了所有的绘图和分析功能。
2. 图片类型齐全:
2.1 能绘制各种类型的统计图。
2.2 可以自定义图片的各个细节,得到漂亮的统计图。
2.3 满足科研数据绘图的所有要求,包括误差条、对数轴、不连续参数轴、希腊字符等。
3. 高质量的图片输出:
3.1 支持多种格式的图片输出,包括高分辨率的TIF格式和EPS格式,满足发表文章的各种需要。
3.2 运用Layout工具,将多个相关的统计图排版到同一个页面中
生物统计
1. 统计分析功能更加实用和精炼,能轻松地利用软件进行实验室和临床研究所需要的统计检验,包括:T检验、nonparametric comparisons、单/双因素方差分析、线性回归、非线性回归、列联表分析、生存分析。
2. 提供完善的统计分析帮助系统,点击统计分析对话框中的“Learn”按钮,打开对应的帮助资源,帮您选择正确的统计方法。
曲线拟合
1. 非线性回归方程齐全,具有强大的非线性回归分析功能。
2.分析过程简单,根据数据选择正确的回归方程后,软件自动进行曲线拟合并生成结果表格以及绘制曲线图。
3.能根据标准曲线自动计算样本结果。
4. 能运用F检验或者Akaike’s Information Criterion对两个拟合方程进行比较
Graphpad Prism棱镜科研绘图工具特色功能
1. 自动生成误差条:输入重复样本的数据后,软件自动计算并在统计图上生成误差条,而不需要人为操作。
2. 同时分析多个相关实验的数据。
3. 分析重复实验的效率高:任何一次分析都可以作为其重复实验的模板,导入重复实验的数据后。
4.软件自动进行数据分析并作图。
5. 修正输入的数据,软件能自动对其分析结果和统计图进行同步修正。
Graphpad Prism棱镜科研绘图工具安装步骤
1、在华军软件园下载这款软件的压缩包,解压后,双击exe文件,进入安装界面,点击browse可以修改默认在C盘的安装位置,建议大家选择安装在D盘,然后点击install
2、软件正在安装,我们耐心等待
3、软件安装成功,点击finish即可
Graphpad Prism棱镜科研绘图工具使用方法
1、数据的录入
打开GraphPad Prism软件后,软件会让操作者选择数据的输入类型,此时注意选择“Column”这个选项。如图2所示:
之后分别输入两组变量的值。如图3所示,实验组共5个样本,检测数值分别为1,2,3,4和5;对照组也是5个样本,分别是4,5,6,7和8。也可以在表头上对数据进行标识,分别为Experiments和Controls。如果此处不进行标识,默认的组名是Dataset A和Dataset B。
2、结果的运算
结果录入完毕后,点击菜单栏中的Analyze,会出现如图4所示的界面。注意左侧一定要选中”t tests (and nonparametric tests)”。
点击图4中的OK,会进入如图5所示界面。在此界面中,软件要求作者选择是否配对(Paired和Unpaired),并决定选择参数检验还是非参数检验。所谓参数检验就是指配对t检验或独立样本t检验,而非参数检验则是指Mann-Whitney U检验或配对Wilcoxon检验。如果选择参数检验(默认两组数据均呈正态分布),软件会让操作者选择方差是否齐。
如果方差齐,软件会选择t检验,如果不齐,软件推荐Welch法。需要说明的一点是,如果两组数据均呈正太分布,但方差不齐,此时应采用校正t检验,目前有三种主要的校正t检验法:Cochran & Cox法、Satterthwait法和Welch法。GraphPad Prism仅支持Welch法。
如果两组数据不呈正太分布,则应该选用非参数检验。非参数的两个选项分别是Mann-Whitney U检验和Kolmogorov-Smirnov检验。一般选择Mann-Whitney U检验。
除了Experimental Design以外,还可以对Optional选项里面的内容进行修改。如图6所示。一般建议选择“Discreptive statistics for each data set”(展示各组数据的均数、中位数、标准差、秩和等)选项。在P value一段,系统默认为双尾检验,一般建议不要更改。
所有的选项选择完毕后,点击OK即可进行计算。
3、结果的解读
结果一般分为两个部分,一是差异是否具有统计学意义;二是差异有多大。如果研究者选择了Mann-Whitney U检验,则可得到如图7所示的结果。
参数分析结果的解读与此类似,只不过多了个F test to compare variances,即方差是否齐。一般认为,P值大于0.10才可以认为两组数据方差相同(注意:是“大于”,不是“小于”!是“0.10”,不是“0.05”!!!!)。
4、检验数据是否呈正态分布
可能有的读者会问GraphPad Prism能否判断数据是否呈正态分布。其实是可以进行正态分布检验的。以上述两组数据为例,首先点击Analyze,然后选择XY Analysis下面的Column statistics。如图8所示:
如图9所示,GraphPad Prism提供了三种检验数据是否呈正态分布的方法:D’Agootino-Pearson法,Kolmogorov-Smirnov法和Shapiro-Wilk法。针对同一种数据,三种方法的计算结果大同小异。虽然GraphPad Prism不推荐用Kolmogorov-Smirnov法,但根据笔者经验,在国际上发表论文时,多采用Kolmogorov-Smirnov法的结果,可能是因为当样本量太小时,Shapiro-Wilk法和D’Agootino-Pearson法无法给出检验结果。当然,也可以三种方法都选择,综合判断数据是否呈正态分布。
选择好统计方法之后点击OK,就可以得到正态检验的结果,如图10所示。需要特别说明的是:在正态检验中,一般认为P大于0.10才表述数据呈正态分布(注意:是“大于”,不是“小于”!是0.10,不是“0.05”!!!!)。在本案例中,两组数据的P值均为0.20,因此可以认为两组数据均呈正态分布。
Graphpad Prism棱镜科研绘图工具常见问题
用Graphpad Prism棱镜科研绘图工具官方版软件绘制散点图及线性分析?
打开Graphpad Prism棱镜科研绘图工具官方版,将Y右侧的第一栏选中,点击create。
分别在X和Group A下方对应的空白处输入组别,并在X、Y下方输入数据。
点击Graphs下方的Data1,输出图片,选择散点图,点击ok。
点击Analyze,点击线性回归(Linear regression)。
点击ok,弹出如下对话框,继续点击Ok,出现拟合好的直线图。
继续点击analyze,开始进行相关性分析。将线性回归改成相关性(correlation)。
点击Ok,弹出如下对话框,继续点击ok。在结果中可以看到散点图的Pearson r 相关性以及P value大小。
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Graphpad Prism棱镜科研绘图工具更新日志
1:优化了性能
2:解决bug问题我们是认真的
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